Publications

2024

Journal articles

titre
Proceedings of the OHBM Brainhack 2022
auteur
Stefano Moia, Hao-Ting Wang, Anibal S. Heinsfeld, Dorota Jarecka, Yu Fang Yang, Stephan Heunis, Michele Svanera, Benjamin De Leener, Andrea Gondová, Sin Kim, Arshitha Basavaraj, Johanna M. M. Bayer, Roza G. Bayrak, Pierre-Louis Bazin, Isil Poyraz Bilgin, Steffen Bollmann, Daniel Borek, Valentina Borghesani, Trang Cao, Gang Chen, Alejandro de La Vega, Sebastian Dresbach, Philipp Ehses, Jan Ernsting, Inês Esteves, Oscar Ferrante, Kelly G. Garner, Rémi Gau, Elodie Germani, Tara Ghafari, Satrajit S. Ghosh, Sarah E. Goodale, Cassandra D. Gould Van Praag, Samuel Guay, Omer Faruk Gulban, Yaroslav O. Halchenko, Michael Hanke, Peer Herholz, Katja Heuer, Felix Hoffstaedter, Ruoqi Huang, Renzo Huber, Ole Jensen, Kan Keeratimahat, Julian Q. Kosciessa, Sladjana Lukic, Neville Magielse, Christopher J. Markiewicz, Caroline G. Martin, Camille Maumet, Anna Menacher, Jeff Mentch, Christian Mönch, Shammi More, Leonardo Muller, Leonardo Muller-Rodriguez, Samuel A. Nastase, Eliana Nicolaisen-Sobesky, Dylan M. Nielson, Christopher R. Nolan, François Paugam, Pedro Pinheiro-Chagas, Ana Luísa Pinho, Alessandra Pizzuti, Benjamin Poldrack, Benedikt A. Poser, Roberta Rocca, Jacob Sanz-Robinson, Kelvin Sarink, Kevin R Sitek, Nadine Spychala, Rüdiger Stirnberg, Michał Szczepanik, Mohammad Torabi, Roberto Toro, Sebastian G. W. Urchs, Sofie L. Valk, Adina S Wagner, Laura K. Waite, Alexander Q. Waite, Lea Waller, Tyler J. Wishard, Jianxiao Wu, Yuchen Zhou, Janine D. Bijsterbosch
article
Aperture Neuro, 2024, ⟨10.52294/001c.92760⟩
DOI
DOI : 10.52294/001c.92760
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https://inria.hal.science/hal-04478342/file/92760-proceedings-of-the-ohbm-brainhack-2022.pdf BibTex
titre
The Past, Present, and Future of the Brain Imaging Data Structure (BIDS)
auteur
Russell Poldrack, Christopher Markiewicz, Stefan Appelhoff, Yoni Ashar, Tibor Auer, Sylvain Baillet, Shashank Bansal, Leandro Beltrachini, Christian Benar, Giacomo Bertazzoli, Suyash Bhogawar, Ross Blair, Marta Bortoletto, Mathieu Boudreau, Teon Brooks, Vince Calhoun, Filippo Maria Castelli, Patricia Clement, Alexander Cohen, Julien Cohen-Adad, Sasha d'Ambrosio, Gilles de Hollander, María de la Iglesia-Vayá, Alejandro de la Vega, Arnaud Delorme, Orrin Devinsky, Dejan Draschkow, Eugene Paul Duff, Elizabeth Dupre, Eric Earl, Oscar Esteban, Franklin Feingold, Guillaume Flandin, Anthony Galassi, Giuseppe Gallitto, Melanie Ganz, Rémi Gau, James Gholam, Satrajit Ghosh, Alessio Giacomel, Ashley Gillman, Padraig Gleeson, Alexandre Gramfort, Samuel Guay, Giacomo Guidali, Yaroslav Halchenko, Daniel Handwerker, Nell Hardcastle, Peer Herholz, Dora Hermes, Christopher Honey, Robert Innis, Horea-Ioan Ioanas, Andrew Jahn, Agah Karakuzu, David Keator, Gregory Kiar, Balint Kincses, Angela Laird, Jonathan Lau, Alberto Lazari, Jon Haitz Legarreta, Adam Li, Xiangrui Li, Bradley Love, Hanzhang Lu, Eleonora Marcantoni, Camille Maumet, Giacomo Mazzamuto, Steven Meisler, Mark Mikkelsen, Henk Mutsaerts, Thomas Nichols, Aki Nikolaidis, Gustav Nilsonne, Guiomar Niso, Martin Norgaard, Thomas Okell, Robert Oostenveld, Eduard Ort, Patrick Park, Mateusz Pawlik, Cyril Pernet, Franco Pestilli, Jan Petr, Christophe Phillips, Jean-Baptiste Poline, Luca Pollonini, Pradeep Reddy Raamana, Petra Ritter, Gaia Rizzo, Kay Robbins, Alexander Rockhill, Christine Rogers, Ariel Rokem, Chris Rorden, Alexandre M Routier, Jose Manuel Saborit-Torres, Taylor Salo, Michael Schirner, Robert Smith, Tamas Spisak, Julia Sprenger, Nicole Swann, Martin Szinte, Sylvain Takerkart, Bertrand Thirion, Adam Thomas, Sajjad Torabian, Gaël Varoquaux, Bradley Voytek, Julius Welzel, Martin Wilson, Tal Yarkoni, Krzysztof Gorgolewski
article
Imaging Neuroscience, 2024, 2, pp.1-19. ⟨10.1162/imag_a_00103⟩
DOI
DOI : 10.1162/imag_a_00103
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https://hal.science/hal-04346097/file/imag_a_00103.pdf BibTex

Conference papers

titre
Uncovering communities of pipelines in the task-fMRI analytical space
auteur
Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
article
IEEE International Conference on Image Processing, Oct 2024, Abu Dhabi, United Arab Emirates. ⟨10.1109/ICIP51287.2024.10647701⟩
DOI
DOI : 10.1109/ICIP51287.2024.10647701
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https://hal.science/hal-04331232/file/icip2024-germ.pdf BibTex
titre
Same Data Meta Analysis for Neurimaging Multiverse Data
auteur
Jeremy Lefort-Besnard, Thomas E. Nichols, Camille Maumet
article
INCF Neuroinformatics Assembly 2024, Sep 2024, Austin (TX), United States
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https://inria.hal.science/hal-04697056/file/SDMA_INCF_2024.pdf BibTex
titre
Systematic review and evaluation of meta-analysis methods for same data meta-analyses in a multiverse setting
auteur
Jeremy Lefort-Besnard, Thomas E. Nichols, Camille Maumet
article
OHBM 2024 - Annual Meeting on Organization for Human Brain Mapping, Jun 2024, Seoul, South Korea. Selected for oral presentation
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https://inria.hal.science/hal-04474780/file/OHBM2024_LefortBesnard.pdf BibTex
titre
Review and evaluation of meta-analysis methods on correlated data for multiverse analysis
auteur
Jeremy Lefort-Besnard, Thomas E. Nichols, Camille Maumet
article
IABM 2024, https://iabm2024.sciencesconf.org/, Mar 2024, Grenoble, France
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https://inria.hal.science/hal-04296407/file/IABM24.pdf BibTex

Habilitation à diriger des recherches

titre
Towards reproducible neuroimaging: Solutions for sharing and re-using brain imaging data
auteur
Camille Maumet
article
Neurosciences. University of Rennes, 2024
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https://inria.hal.science/tel-04458543/file/Maumet_hdr.pdf BibTex

Preprints, Working Papers, ...

titre
Statistical Inference for Same Data Meta-Analysis in Neuroimaging Multiverse Analyzes
auteur
Jeremy Lefort-Besnard, Thomas E. Nichols, Camille Maumet
article
2024
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https://inria.hal.science/hal-04754078/file/SDMA_paper_preprint.pdf BibTex
titre
The HCP multi-pipeline dataset: an opportunity to investigate analytical variability in fMRI data analysis
auteur
Elodie Germani, Elisa Fromont, Pierre Maurel, Camille Maumet
article
2024
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https://inserm.hal.science/inserm-04356768/file/main.pdf BibTex
titre
Mitigating analytical variability in fMRI results with style transfer
auteur
Elodie Germani, Camille Maumet, Elisa Fromont
article
2024
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https://inserm.hal.science/inserm-04531405/file/elsarticle-template-num.pdf BibTex
titre
On the validity of fMRI mega-analyses using data processed with different pipelines
auteur
Elodie Germani, Xavier Rolland, Pierre Maurel, Camille Maumet
article
2024
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https://inserm.hal.science/inserm-04466478/file/template.pdf BibTex

2023

Journal articles

titre
On the benefits of self-taught learning for brain decoding
auteur
Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
article
GigaScience, 2023, 12, pp.1-17. ⟨10.1093/gigascience/giad029⟩
DOI
DOI : 10.1093/gigascience/giad029
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https://inria.hal.science/hal-03769993/file/on_the_benefits_of_self_taught_learning.pdf BibTex
titre
Successful reproduction of a large EEG study across software packages
auteur
Aya Kabbara, Nina Forde, Camille Maumet, Mahmoud Hassan
article
Neuroimage: Reports, In press, 3 (2), pp.100169. ⟨10.1016/j.ynirp.2023.100169⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.ynirp.2023.100169
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https://inserm.hal.science/inserm-03747289/file/Kabbara_1-s2.0-S2666956023000144-main.pdf BibTex

Conference papers

titre
Systematic review and evaluation of meta-analysis methods for same data meta-analyses
auteur
Jeremy Lefort-Besnard, Thomas E Nichols​, Camille Maumet
article
Cogbases-2023 - Workshop on open science methods for analyzing brain imaging data, Institut Pasteur, Paris; Parietal team, Inria, Paris Saclay, Oct 2023, Paris, France. pp.1-1
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https://inserm.hal.science/inserm-04222730/file/cogbases23_abstract.pdf BibTex
titre
Exploring variability patterns in the task-fMRI analytical space
auteur
Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
article
OHBM 2023 - 29th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jul 2023, Montreal, Canada
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https://inria.hal.science/hal-03991042/file/abstract_OHBM.pdf BibTex
titre
Representation learning for more reproducible fMRI data analyses
auteur
Elodie Germani, Elisa Fromont, Camille Maumet
article
IABM 2023 - Colloque Français d'Intelligence Artificielle en Imagerie Biomédical, Mar 2023, Paris, France. pp.1
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https://inria.hal.science/hal-04068797/file/poster_elodiegermani.pdf BibTex

2022

Journal articles

titre
Review Paper: Reporting Practices for Task fMRI Studies
auteur
Freya Acar, Camille Maumet, Talia Heuten, Maya Vervoort, Han Bossier, Ruth Seurinck, Beatrijs Moerkerke
article
Neuroinformatics, 2022, ⟨10.1007/s12021-022-09606-2⟩
DOI
DOI : 10.1007/s12021-022-09606-2
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https://inserm.hal.science/inserm-03800029/file/Review%20paper_reporting%20practices%20for%20fMRI%20studies_Acaretal_Neuroinformatics.pdf BibTex
titre
Open and reproducible neuroimaging: from study inception to publication
auteur
Guiomar Niso, Rotem Botvinik-Nezer, Stefan Appelhoff, Alejandro de La Vega, Oscar Esteban, Joset Etzel, Karolina Finc, Melanie Ganz, Remi Gau, Yaroslav Halchenko, Peer Herholz, Agah Karakuzu, David Keator, Christopher Johnson Markiewicz, Camille Maumet, Cyril Pernet, Franco Pestilli, Nazek Queder, Tina Schmitt, Weronika Sójka, Adina Svenja Wagner, Kirstie Jane Whitaker, Jochem Rieger
article
NeuroImage, 2022, ⟨10.1016/j.neuroimage.2022.119623⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2022.119623
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https://inserm.hal.science/inserm-03646706/file/Open%20and%20reproducible%20neuroimage_2022.pdf BibTex
titre
Isolating the Sources of Pipeline-Variability in Group-Level Task-fMRI results
auteur
Alexander Bowring, Thomas Nichols, Camille Maumet
article
Human Brain Mapping, 2022, 43 (3), pp.1112-1128. ⟨10.1002/hbm.25713⟩
DOI
DOI : 10.1002/hbm.25713
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https://inserm.hal.science/inserm-03323001/file/2021.07.27.453994v1.full.pdf BibTex

Conference papers

titre
FMRI data analysis: How does analytical variability vary with sample size?
auteur
Elodie Germani, Camille Maumet
article
OHBM 2022 - 28th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2022, Glasgow, United Kingdom. pp.1-5
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https://inserm.hal.science/inserm-03642535/file/abstract_analytical_variability_sample_size_egermani_cmaumet.pdf BibTex
titre
Towards efficient fmri data re-use: can we run between-group analyses with datasets processed differently with spm ?
auteur
Xavier Rolland, Pierre Maurel, Camille Maumet
article
ISBI 2022 - IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Mar 2022, Calcutta, India. pp.1-4
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https://hal.science/hal-03607384/file/ISBI_R_vision-1.pdf BibTex

2021

Journal articles

titre
Centering inclusivity in the design of online conferences - An OHBM - Open Science perspective
auteur
Elizabeth Levitis, Cassandra Gould van Praag, Remi Gau, Stephan Heunis, Elizabeth Dupre, Greg Kiar, Katherine Bottenhorn, Tristan Glatard, Aki Nikolaidis, Kirstie Jane Whitaker, Matteo Mancini, Guiomar Niso, Soroosh Afyouni, Eva Alonso Ortiz, Stefan Appelhoff, Aurina Arnatkeviciute, Melvin Selim Atay, Tibor Auer, Giulia Baracchini, Johanna Margarete Marianne Bayer, Michael J. S. Beauvais, Janine Diane Bijsterbosch, Isil Poyraz Bilgin, Saskia Bollmann, Steffen Bollmann, Rotem Botvinik-Nezer, Molly Bright, Vince Calhoun, Xiao Chen, Sidhant Chopra, Hu Chuan-Peng, Thomas Close, Savannah Cookson, Cameron Craddock, Alejandro de La Vega, Benjamin de Leener, Damion Demeter, Paola Di Maio, Erin Dickie, Simon Eickhoff, Oscar Esteban, Karolina Finc, Matteo Frigo, Saampras Ganesan, Melanie Ganz, Kelly Garner, Eduardo Garza-Villarreal, Gabriel Gonzalez-Escamilla, Rohit Goswami, John David Griffiths, Tijl Grootswagers, Samuel Guay, Olivia Guest, Daniel Handwerker, Peer Herholz, Katja Heuer, Dorien Huijser, Vittorio Iacovella, Michael Joseph, Agah Karakuzu, David Keator, Xenia Kobeleva, Manoj Kumar, Angie Laird, Linda Larson-Prior, Alexandra Lautarescu, Alberto Lazari, Jon Haitz Legarreta Gorroño, Xue-Ying Li, Jinglei Lv, Sina Mansour, David Meunier, Dustin Moraczewski, Tulika Nandi, Samuel Nastase, Matthias Nau, Stephanie Noble, Martin Norgaard, Johnes Obungoloch, Robert Oostenveld, Edwina Orchard, Ana Luísa Pinho, Russell Poldrack, Anqi Qiu, Pradeep Reddy Raamana, Ariel Rokem, Saige Rutherford, Malvika Sharan, Thomas Shaw, Warda Syeda, Meghan Testerman, Roberto Toro, Sofie Valk, Sofie van den Bossche, Gael Varoquaux, Frantisek Vasa, Michele Veldsman, Jakub Vohryzek, Adina Svenja Wagner, Reubs Walsh, Tonya White, Fu-Te Wong, Xihe Xie, Chao-Gan Yan, Yu-Fang Yang, Yohan Yee, Gaston Zanitti, Ana van Gulick, Eugene Duff, Camille Maumet
article
GigaScience, 2021, 10 (8), ⟨10.1093/gigascience/giab051⟩
DOI
DOI : 10.1093/gigascience/giab051
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https://inserm.hal.science/inserm-03221005/file/giab051.pdf BibTex
titre
GliMR: Cross-Border Collaborations to Promote Advanced MRI Biomarkers for Glioma
auteur
Patricia Clement, Thomas Booth, Fran Borovečki, Kyrre E. Emblem, Patrícia Figueiredo, Lydiane Hirschler, Radim Jančálek, Vera C. Keil, Camille Maumet, Yelda Özsunar, Cyril Pernet, Jan Petr, Joana Pinto, Marion Smits, Esther A. H. Warnert
article
Journal of Medical and Biological Engineering, 2021, 41 (2), pp.115-125. ⟨10.1007/s40846-020-00582-z⟩
DOI
DOI : 10.1007/s40846-020-00582-z
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https://inserm.hal.science/inserm-03039808/file/Clement2020_Article_GliMRCross-BorderCollaboration.pdf BibTex
titre
Brainhack: Developing a culture of open, inclusive, community-driven neuroscience
auteur
Rémi Gau, Stephanie Noble, Katja Heuer, Katherine Bottenhorn, Isil Bilgin, Yu-Fang Yang, Julia Huntenburg, Johanna M.M. Bayer, Richard A.I. Bethlehem, Shawn Rhoads, Christoph Vogelbacher, Valentina Borghesani, Elizabeth Levitis, Hao-Ting Wang, Sofie van den Bossche, Xenia Kobeleva, Jon Haitz Legarreta, Samuel Guay, Selim Melvin Atay, Gael Varoquaux, Dorien Huijser, Malin Sandström, Peer Herholz, Samuel Nastase, Amanpreet Badhwar, Guillaume Dumas, Simon Schwab, Stefano Moia, Michael Dayan, Yasmine Bassil, Paula Brooks, Matteo Mancini, James Shine, David O’connor, Xihe Xie, Davide Poggiali, Patrick Friedrich, Anibal Heinsfeld, Lydia Riedl, Roberto Toro, César Caballero-Gaudes, Anders Eklund, Kelly Garner, Christopher Nolan, Damion Demeter, Fernando Barrios, Junaid Merchant, Elizabeth Mcdevitt, Robert Oostenveld, R. Cameron Craddock, Ariel Rokem, Andrew Doyle, Satrajit Ghosh, Aki Nikolaidis, Olivia Stanley, Eneko Uruñuela, Nasim Anousheh, Aurina Arnatkeviciute, Guillaume Auzias, Dipankar Bachar, Elise Bannier, Ruggero Basanisi, Arshitha Basavaraj, Marco Bedini, Pierre Bellec, R. Austin Benn, Kathryn Berluti, Steffen Bollmann, Saskia Bollmann, Claire Bradley, Jesse Brown, Augusto Buchweitz, Patrick Callahan, Micaela Chan, Bramsh Chandio, Theresa Cheng, Sidhant Chopra, Ai Wern Chung, Thomas Close, Etienne Combrisson, Giorgia Cona, R. Todd Constable, Claire Cury, Kamalaker Dadi, Pablo Damasceno, Samir Das, Fabrizio de Vico Fallani, Krista Destasio, Erin Dickie, Lena Dorfschmidt, Eugene Duff, Elizabeth Dupre, Sarah Dziura, Nathalia Esper, Oscar Esteban, Shreyas Fadnavis, Guillaume Flandin, Jessica Flannery, John Flournoy, Stephanie Forkel, Alexandre Franco, Saampras Ganesan, Siyuan Gao, José García Alanis, Eleftherios Garyfallidis, Tristan Glatard, Enrico Glerean, Javier Gonzalez-Castillo, Cassandra Gould van Praag, Abigail Greene, Geetika Gupta, Catherine Alice Hahn, Yaroslav Halchenko, Daniel Handwerker, Thomas Hartmann, Valérie Hayot-Sasson, Stephan Heunis, Felix Hoffstaedter, Daniela Hohmann, Corey Horien, Horea-Ioan Ioanas, Alexandru Iordan, Chao Jiang, Michael Joseph, Jason Kai, Agah Karakuzu, David Kennedy, Anisha Keshavan, Ali Khan, Gregory Kiar, P. Christiaan Klink, Vincent Koppelmans, Serge Koudoro, Angela Laird, Georg Langs, Marissa Laws, Roxane Licandro, Sook-Lei Liew, Tomislav Lipic, Krisanne Litinas, Daniel Lurie, Désirée Lussier, Christopher Madan, Lea-Theresa Mais, Sina Mansour L, Jose Pedro Manzano-Patron, Dimitra Maoutsa, Matheus Marcon, Daniel Margulies, Giorgio Marinato, Daniele Marinazzo, Christopher Markiewicz, Camille Maumet, Felipe Meneguzzi, David Meunier, Michael Milham, Kathryn Mills, Davide Momi, Clara Moreau, Aysha Motala, Iska Moxon-Emre, Thomas Nichols, Dylan Nielson, Gustav Nilsonne, Lisa Novello, Caroline O’brien, Emily Olafson, Lindsay Oliver, John Onofrey, Edwina Orchard, Kendra Oudyk, Patrick Park, Mahboobeh Parsapoor, Lorenzo Pasquini, Scott Peltier, Cyril Pernet, Rudolph Pienaar, Pedro Pinheiro-Chagas, Jean-Baptiste Poline, Anqi Qiu, Tiago Quendera, Laura Rice, Joscelin Rocha-Hidalgo, Saige Rutherford, Mathias Scharinger, Dustin Scheinost, Deena Shariq, Thomas Shaw, Viviana Siless, Molly Simmonite, Nikoloz Sirmpilatze, Hayli Spence, Julia Sprenger, Andrija Stajduhar, Martin Szinte, Sylvain Takerkart, Angela Tam, Link Tejavibulya, Michel Thiebaut de Schotten, Ina Thome, Laura Tomaz da Silva, Nicolas Traut, Lucina Uddin, Antonino Vallesi, John Vanmeter, Nandita Vijayakumar, Matteo Visconti Di Oleggio Castello, Jakub Vohryzek, Jakša Vukojević, Kirstie Jane Whitaker, Lucy Whitmore, Steve Wideman, Suzanne Witt, Hua Xie, Ting Xu, Chao-Gan Yan, Fang-Cheng Yeh, B.T. Thomas Yeo, Xi-Nian Zuo
article
Neuron, 2021, 109 (11), pp.1769-1775. ⟨10.1016/j.neuron.2021.04.001⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.neuron.2021.04.001
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https://inserm.hal.science/inserm-03221248/file/Gau%20et%20al.%20-%202021%20-%20Brainhack%20Developing%20a%20culture%20of%20open%2C%20inclusive.pdf BibTex
titre
The Open Brain Consent : Informing research participants and obtaining consent to share brain imaging data
auteur
Elise Bannier, Gareth Barker, Valentina Borghesani, Nils Broeckx, Patricia Clement, Kyrre Emblem, Satrajit Ghosh, Enrico Glerean, Krzysztof Gorgolewski, Marko Havu, Yaroslav Halchenko, Peer Herholz, Anne Hespel, Stephan Heunis, Yue Hu, Chuan‐peng Hu, Dorien Huijser, María Iglesia Vayá, Radim Jancalek, Vasileios Katsaros, Marie‐luise Kieseler, Camille Maumet, Clara Moreau, Henk‐jan Mutsaerts, Robert Oostenveld, Esin Ozturk‐isik, Nicolas Pascual Leone Espinosa, John Pellman, Cyril Pernet, Francesca Benedetta Pizzini, Amira Šerifović Trbalić, Paule‐joanne Toussaint, Matteo Visconti Di Oleggio Castello, Fengjuan Wang, Cheng Wang, Hua Zhu
article
Human Brain Mapping, 2021, 42 (7), pp.1945-1951. ⟨10.1002/hbm.25351⟩
DOI
DOI : 10.1002/hbm.25351
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https://inserm.hal.science/inserm-03128167/file/hbm.25351.pdf BibTex

Conference papers

titre
BIDS Statistical Models - An implementation-independent representation of General Linear Models
auteur
Christopher Markiewicz, Katherine Bottenhorn, Gang Chen, Alejandro de La Vega, Oscar Esteban, Camille Maumet, Thomas Nichols, Russell Poldrack, Jean-Baptiste Poline, Tal Yarkoni
article
OHBM 2021 - 27th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2021, Online, South Korea. pp.1-4
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https://inserm.hal.science/inserm-03478963/file/OHBM2021-Bids-stats-models.pdf BibTex
titre
Identifying sources of software-dependent differences in task fMRI analyses
auteur
Alexander Bowring, Thomas Nichols, Camille Maumet
article
OHBM 2021 - 27th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2021, Online, South Korea. pp.1-4
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https://inserm.hal.science/inserm-03479022/file/OHBM%202021_%20Software%20Comparison%20Abstract.pdf BibTex
titre
BIDS-prov: a provenance framework for BIDS
auteur
Rémi Adon, Stefan Appelhoff, Tibor Auer, Laurent Guillo, Yaroslav O Halchenko, David Keator, Christopher J Markiewicz, Thomas E Nichols, Jean-Baptiste Poline, Satrajit Ghosh, Camille Maumet
article
OHBM 2021 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2021, Online, South Korea. pp.1-3
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https://inserm.hal.science/inserm-03478998/file/OHBM2021-Bids-prov.pdf BibTex

Book sections

titre
L'imagerie au service de la santé : questions éthiques et sociétales
auteur
Élise Bannier, Anne Hespel, Camille Maumet
article
Le corps en images : Les nouvelles imagerie pour la santé, A paraître
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https://inserm.hal.science/inserm-03480620/file/bannier-hespel-maumet-corps-en-images-v2.pdf BibTex

2020

Journal articles

titre
Variability in the analysis of a single neuroimaging dataset by many teams
auteur
Rotem Botvinik-Nezer, Felix Holzmeister, Colin F Camerer, Anna Dreber, Juergen Huber, Magnus Johannesson, Michael Kirchler, Roni Iwanir, Jeanette A Mumford, R. Alison Adcock, Paolo Avesani, Blazej M Baczkowski, Aahana Bajracharya, Leah Bakst, Sheryl Ball, Marco Barilari, Nadège Bault, Derek Beaton, Julia Beitner, Roland G Benoit, Ruud M.W.J. Berkers, Jamil P Bhanji, Bharat B Biswal, Sebastian Bobadilla-Suarez, Tiago Bortolini, Katherine L Bottenhorn, Alexander Bowring, Senne Braem, Hayley R Brooks, Emily G Brudner, Cristian B Calderon, Julia A Camilleri, Jaime J Castrellon, Luca Cecchetti, Edna C Cieslik, Zachary J Cole, Olivier Collignon, Robert W Cox, William A Cunningham, Stefan Czoschke, Kamalaker Dadi, Charles P Davis, Alberto De Luca, Mauricio R Delgado, Lysia Demetriou, Jeffrey B Dennison, Xin Di, Erin W Dickie, Ekaterina Dobryakova, Claire L Donnat, Juergen Dukart, Niall W Duncan, Joke Durnez, Amr Eed, Simon B. Eickhoff, Andrew Erhart, Laura Fontanesi, G. Matthew Fricke, Shiguang Fu, Adriana Galván, Remi Gau, Sarah Genon, Tristan Glatard, Enrico Glerean, Jelle J Goeman, Sergej A.E. Golowin, Carlos González-García, Krzysztof J Gorgolewski, Cheryl L Grady, Mikella A Green, João F Guassi Moreira, Olivia Guest, Shabnam Hakimi, J. Paul Hamilton, Roeland Hancock, Giacomo Handjaras, Bronson B Harry, Colin Hawco, Peer Herholz, Gabrielle Herman, Stephan Heunis, Felix Hoffstaedter, Jeremy Hogeveen, Susan Holmes, Chuan-Peng Hu, Scott A Huettel, Matthew E Hughes, Vittorio Iacovella, Alexandru D Iordan, Peder M Isager, Ayse I Isik, Andrew Jahn, Matthew R Johnson, Tom Johnstone, Michael J.E. Joseph, Anthony C Juliano, Joseph W Kable, Michalis Kassinopoulos, Cemal Koba, Xiang-Zhen Kong, Timothy R Koscik, Nuri Erkut Kucukboyaci, Brice A Kuhl, Sebastian Kupek, Angela R Laird, Claus Lamm, Robert Langner, Nina Lauharatanahirun, Hongmi Lee, Sangil Lee, Alexander Leemans, Andrea Leo, Elise Lesage, Flora Li, Monica Y.C. Li, Phui Cheng Lim, Evan N Lintz, Schuyler W Liphardt, Annabel B Losecaat Vermeer, Bradley C Love, Michael L Mack, Norberto Malpica, Theo Marins, Camille Maumet, Kelsey Mcdonald, Joseph T Mcguire, Helena Melero, Adriana S Méndez Leal, Benjamin Meyer, Kristin N Meyer, Glad Mihai, Georgios D. Mitsis, Jorge Moll, Dylan M Nielson, Gustav Nilsonne, Michael P Notter, Emanuele Olivetti, Adrian I Onicas, Paolo Papale, Kaustubh R Patil, Jonathan E Peelle, Alexandre Pérez, Doris Pischedda, Jean-Baptiste Poline, Yanina Prystauka, Shruti Ray, Patricia A Reuter-Lorenz, Richard C Reynolds, Emiliano Ricciardi, Jenny R Rieck, Anais M Rodriguez-Thompson, Anthony Romyn, Taylor Salo, Gregory R Samanez-Larkin, Emilio Sanz-Morales, Margaret L Schlichting, Douglas H Schultz, Qiang Shen, Margaret A Sheridan, Jennifer A Silvers, Kenny Skagerlund, Alec Smith, David V Smith, Peter Sokol-Hessner, Simon R Steinkamp, Sarah M Tashjian, Bertrand Thirion, John N Thorp, Gustav Tinghög, Loreen Tisdall, Steven H Tompson, Claudio Toro-Serey, Juan Jesus Torre Tresols, Leonardo Tozzi, Vuong Truong, Luca Turella, Anna E van ‘t Veer, Tom Verguts, Jean M Vettel, Sagana Vijayarajah, Khoi Vo, Matthew B Wall, Wouter D Weeda, Susanne Weis, David J White, David Wisniewski, Alba Xifra-Porxas, Emily A Yearling, Sangsuk Yoon, Rui Yuan, Kenneth S.L. Yuen, Lei Zhang, Xu Zhang, Joshua E Zosky, Thomas E. Nichols, Russell A Poldrack, Tom Schonberg
article
Nature, 2020, 582 (7810), pp.84-88. ⟨10.1038/s41586-020-2314-9⟩
DOI
DOI : 10.1038/s41586-020-2314-9
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BibTex

Conference papers

titre
Open Science in action: Doing research as a community!
auteur
Camille Maumet
article
OHBM 2020 - 26th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2020, Virtual, Canada. pp.1-19
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https://inserm.hal.science/inserm-02909437/file/OHBM2020%20-%20Camille%20Maumet%20-%20OS-SIG%20symposium.pdf BibTex

Reports

titre
État des lieux MoDaL (Multi-Scale Data Links)
auteur
Aurélien Cornet, Christian Barillot, Olivier Dameron, Alban Gaignard, Camille Maumet, Richard Redon, Anne Siegel
article
[Rapport de recherche] IRISA, Inria Rennes. 2020
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https://hal.science/hal-02557351/file/MoDaL_2019_synthese_Ver1.pdf BibTex
titre
WorkShop MoDaL (Multi-Scale Data Links)
auteur
Aurélien Cornet, Christian Barillot, Olivier Dameron, Alban Gaignard, Camille Maumet, Richard Redon, Anne Siegel
article
[Rapport de recherche] IRISA, Inria Rennes. 2020
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https://inserm.hal.science/inserm-02507799/file/MoDaL_2019_workshop_report_V4.pdf BibTex

2019

Journal articles

titre
Exploring the Impact of Analysis Software on Task fMRI Results
auteur
Alexander Bowring, Camille Maumet, Thomas E. Nichols
article
Human Brain Mapping, 2019, 40 (11), pp.3362-3384. ⟨10.1002/hbm.24603⟩
DOI
DOI : 10.1002/hbm.24603
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https://inserm.hal.science/inserm-01760535/file/285585.full.pdf BibTex

Conference papers

titre
Tools for FAIR Neuroimaging Experiment Metadata Annotation with NIDM Experiment
auteur
David Keator, Karl Helmer, Camille Maumet, Smruti Padhy, Dorota Jarecka, David N. Kennedy, Satrajit Ghosh, Jean-Baptiste Poline
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping,, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-5
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https://inserm.hal.science/inserm-02379309/file/OHBM2019_Keator.pdf BibTex
titre
Open research: linking the bits and pieces with OpenAIRE-connect
auteur
Camille Maumet, Xavier Rolland, Axel Bonnet, Sorina Camarasu-Pop, Argiro Kokogiannaki, Christian Barillot
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-6
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https://inserm.hal.science/inserm-02151177/file/OHBM%202019_%20OpenAIRE-Connect%281%29.pdf BibTex
titre
The best of both worlds: using semantic web with JSON-LD. An example with NIDM-Results & Datalad
auteur
Camille Maumet, Satrajit Ghosh, Yaroslav O. Halchenko, Dorota Jarecka, Nolan B. Nichols, Jean-Baptiste Poline, Michael Hanke
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Rome, Italy
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https://inserm.hal.science/inserm-01972649/file/NIDM-Results_Datalad.pdf BibTex
titre
Constructing an Ontology of Neuroscience Experiments for the Neuroimaging Data Model (NIDM) Authors: Introduction
auteur
Karl Helmer, David Keator, Tibor Auer, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Thomas Nichols, Jean-Baptiste Poline
article
OHBM 2019 - 25th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2019, Jun 2019, Rome, Italy. pp.1-4
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https://inserm.hal.science/inserm-02379281/file/OHBM2019_Helmer.pdf BibTex

2018

Conference papers

titre
Open Science for the Neuroinformatics community
auteur
Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Camille Maumet, Michael Kain, Christian Barillot, Tristan Glatard
article
DI4R 2018 - Digital Infrastructures for Research, Oct 2018, Lisbon, Portugal. pp.1
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https://inserm.hal.science/inserm-01846994/file/DI4R%202018%20-%20Open%20Science%20for%20the%20Neuroinformatics%20community.pdf BibTex
titre
Interoperability with Boutiques and CARMIN
auteur
Sorina Camarasu-Pop, Axel Bonnet, Camille Maumet, Michael Kain, Christian Barillot, Tristan Glatard
article
DI4R 2018 - Digital Infrastructures for Research, Oct 2018, Lisbon, Portugal. pp.1
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https://inserm.hal.science/inserm-01846997/file/DI4R%202018%20-%20Interoperability%20with%20Boutiques%20and%20CARMIN.pdf BibTex
titre
Choosing a practical and valid Image-Based Meta-Analysis
auteur
Camille Maumet, Thomas E. Nichols
article
OHBM 2018 - 24th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-3
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https://inserm.hal.science/inserm-01933032/file/Maumet_OHBM2018_IBMA.pdf BibTex
titre
Same Data - Different Software - Different Results? Analytic Variability of Group fMRI Results
auteur
Alexander Bowring, Thomas E. Nichols, Camille Maumet
article
OHBM 2018 - 24th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-3
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https://inserm.hal.science/inserm-01933019/file/Bowring_OHBM2018.pdf BibTex
titre
Development of an Ontology for the INCF Neuroimaging Data Model (NIDM)
auteur
Karl G Helmer, Keator B David, Tibor Auer, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Thomas E. Nichols, Padhy Smruti, Jean-Baptiste Poline
article
OHBM 2018 - 24th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-2
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https://inserm.hal.science/inserm-01932994/file/Helmer_OHBM2018_NIDM-ontology.pdf BibTex
titre
Validity of summary statistics-based mixed-effects group fMRI
auteur
Camille Maumet, Thomas E. Nichols
article
OHBM 2018 - 24th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-2
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https://inserm.hal.science/inserm-01887911/file/Maumet_OHBM2018_validity_summary_stat.pdf BibTex
titre
Detecting and Interpreting Heterogeneity and Publication Bias in Image-Based Meta-Analyses
auteur
Thomas Maullin-Sapey, Camille Maumet, Thomas E. Nichols
article
OHBM 2018 - 24th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore
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https://inserm.hal.science/inserm-01933023/file/MaullinSapey_OHBM2018.pdf BibTex
titre
A standardised representation for non-parametric fMRI results
auteur
Camille Maumet, Guillaume Flandin, Martin Perez-Guevara, Jean-Baptiste Poline, Justin Rajendra, Richard Reynolds, Bertrand Thirion, Thomas E. Nichols
article
OHBM 2018 - Annual meeting of the Organization of Human Brain Mapping, Jun 2018, Singapore, Singapore. pp.1-4
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https://inserm.hal.science/inserm-01828914/file/MAUMET_OHBM2018_nonparametricNIDMResults.pdf BibTex

2017

Journal articles

titre
Accelerating permutation testing in voxel-wise analysis through subspace tracking: A new plugin for SnPM
auteur
Felipe Gutierrez-Barragan, Vamsi K. Ithapu, Chris Hinrichs, Camille Maumet, Sterling C. Johnson, Thomas E. Nichols, Vikas Singh
article
NeuroImage, 2017, ⟨10.1016/j.neuroimage.2017.07.025⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2017.07.025
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Conference papers

titre
Impact of Analysis Software on Replication of fMRI Studies
auteur
Alexander Bowring, Thomas E Nichols, Camille Maumet
article
Annual meeting of the Organisation of Human Brain Mapping (OHBM 2017), Jun 2017, Vancouver, Canada
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BibTex
titre
Viewing FSL results with SPM and vice versa
auteur
Thomas Maullin-Sapey, Peter Williams, Guillaume Flandin, Thomas E Nichols, Camille Maumet
article
2017 Annual meeting of the Organisation of Human Brain Mapping (OHBM 2017), Jun 2017, Vancouver, Canada
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https://inserm.hal.science/inserm-01570795/file/OHBM2017_MaullinSapey_poster.pdf BibTex
titre
Constructing an Ontology for Neuroimaging Experiments (NIDM-Experiment)
auteur
Karl Helmer, Tibor Auer, Satrajit Ghosh, David Keator, Camille Maumet, B. Nolan Nichols, Thomas E. Nichols, Jessica Turner, Jean Baptiste Poline
article
Annual meeting of the Organisation of Human Brain Mapping (OHBM 2017), Jun 2017, Vancouver, Canada
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BibTex
titre
Capturing and Reusing Computation Details with the Neuroimaging Data Model (NIDM)
auteur
Satrajit Ghosh, Tibor Auer, Guillaume Flandin, Tristan Glatard, Krzysztof Gorgolewski, Yaroslav Halchenko, Jarecka Dorota, David Keator, Camille Maumet, Thomas E Nichols, Padhy Smruti, Jean Baptiste Poline
article
Annual meeting of the Organisation of Human Brain Mapping (OHBM 2017), Jun 2017, Vancouver, Canada
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BibTex
titre
Viewing FSL results with SPM and vice versa
auteur
Thomas Maullin-Sapey​, Peter Williams, Guillaume Flandin​, Thomas E Nichols​, Camille Maumet
article
2017 Annual meeting of the Organisation of Human Brain Mapping (OHBM 2017), Jun 2017, Vancouver, Canada
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https://inserm.hal.science/inserm-01570610/file/OHBM2017_MaullinSapey.pdf BibTex
titre
Describing Experiment Metadata with the Neuroimaging Data Model (NIDM)
auteur
David Keator, Karl Helmer, Satrajit Ghosh, Tibor Auer, Camille Maumet, Samir Das, Guillaume Flandin, Thomas E. Nichols, Krzysztof Gorgolewski, Jessica Turner, David Kennedy, Jean Baptiste Poline, B. Nolan Nichols
article
Annual meeting of the Organisation of Human Brain Mapping (OHBM 2017), Jun 2017, Vancouver, Canada
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BibTex
titre
Reading and displaying standardised neuroimaging results in a user-friendly environment
auteur
Thomas Maullin-Sapey, Guillaume Flandin, Camille Maumet, Thomas E Nichols
article
West Midlands Health Informatics Network annual conference, Jan 2017, Coventry, United Kingdom
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https://inserm.hal.science/inserm-01571689/file/maullin_t_win2017.pdf BibTex
titre
Towards reproducible brain imaging research
auteur
Camille Maumet, Alexander Bowring, Thomas E Nichols
article
West Midlands Health Informatics Network annual conference, Jan 2017, Coventry, United Kingdom
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https://inserm.hal.science/inserm-01571688/file/maumet_c_win2017.pdf BibTex

Reports

titre
Generating and reporting peak and cluster tables for voxel-wise inference in FSL
auteur
Camille Maumet, Thomas Nichols
article
Research Ideas and Outcomes. 2017
DOI
DOI : 10.3897/rio.3.e12368
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https://inserm.hal.science/inserm-01565182/file/RIO_article_12368.pdf BibTex

2016

Journal articles

titre
Sharing brain mapping statistical results with the neuroimaging data model
auteur
Camille Maumet, Tibor Auer, Alexander Bowring, Gang Chen, Samir Das, Guillaume Flandin, Satrajit Ghosh, Tristan Glatard, Krzysztof J Gorgolewski, Karl G Helmer, Mark Jenkinson, David B Keator, B. Nolan Nichols, Jean-Baptiste Poline, Richard Reynolds, Vanessa Sochat, Jessica Turner, Thomas E Nichols
article
Scientific Data , 2016, 3, ⟨10.1038/sdata.2016.102⟩
DOI
DOI : 10.1038/sdata.2016.102
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https://inserm.hal.science/inserm-01411025/file/sdata2016102.pdf BibTex
titre
Exploring fMRI Results Space: 31 Variants of an fMRI Analysis in AFNI, FSL, and SPM
auteur
Ruth Pauli, Alexander Bowring, Richard Reynolds, Gang Chen, Thomas E. Nichols, Camille Maumet
article
Frontiers in Neuroinformatics, 2016, 10, ⟨10.3389/fninf.2016.00024⟩
DOI
DOI : 10.3389/fninf.2016.00024
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https://inserm.hal.science/inserm-01341946/file/fninf-10-00024.pdf BibTex
titre
An a contrario approach for the detection of patient-specific brain perfusion abnormalities with arterial spin labelling
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
article
NeuroImage, 2016, 134, ⟨10.1016/j.neuroimage.2016.03.054⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2016.03.054
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https://inserm.hal.science/inserm-01291748/file/Maumet_NeuroImage_A_Contrario.pdf BibTex
titre
The brain imaging data structure, a format for organizing and describing outputs of neuroimaging experiments
auteur
Krzysztof J. Gorgolewski, Tibor Auer, Vince D. Calhoun, Cameron R. Craddock, Samir Das, Eugene P. Duff, Guillaume Flandin, Satrajit S. Ghosh, Tristan Glatard, Yaroslav O. Halchenko, Daniel A. Handwerker, Michael Hanke, David Keator, Xiangrui Li, Zachary Michael, Camille Maumet, Nolan B. Nichols, Thomas E. Nichols, John Pellman, Jean-Baptiste Poline, Ariel Rokem, Gunnar Schaefer, Vanessa Sochat, William Triplett, Jessica A. Turner, Gaël Varoquaux, Russell A. Poldrack
article
Scientific Data , 2016, 3, pp.160044. ⟨10.1038/sdata.2016.44⟩
DOI
DOI : 10.1038/sdata.2016.44
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https://inserm.hal.science/inserm-01345616/file/sdata201644.pdf BibTex
titre
When the Single Matters more than the Group (II): Addressing the Problem of High False Positive Rates in Single Case Voxel Based Morphometry Using Non-parametric Statistics
auteur
Cristina Scarpazza, Thomas E. Nichols, Donato Seramondi, Camille Maumet, Giuseppe Sartori, Andrea Mechelli
article
Frontiers in Neuroscience, 2016, 10 (6), ⟨10.3389/fnins.2016.00006⟩
DOI
DOI : 10.3389/fnins.2016.00006
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https://inserm.hal.science/inserm-01261239/file/fnins-10-00006.pdf BibTex

Conference papers

titre
Describing Assessments and Experiment Metadata with the Neuroimaging Data Model (NIDM)
auteur
Keator B David, Helmer G Karl, Satrajit S Ghosh, Auer Tibor, Camille Maumet, Das Samir, Flandin Guillaume, Nichols Thomas, Krzysztof J Gorgolewski, Jessica Turner, Kennedy David, Jean-Baptiste Poline, B. Nolan Nichols
article
Neuroinformatics 2016, Sep 2016, Reading, United Kingdom. ⟨10.3389/conf.fninf.2016.20.00069⟩
DOI
DOI : 10.3389/conf.fninf.2016.20.00069
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https://inserm.hal.science/inserm-01570945/file/INCF%202016%20-%20Neuroinformatics-NIDM-Experiment.pdf BibTex
titre
The Brain Imaging Data Structure: a format for organizing and describing neuroimaging data
auteur
Krzysztof Gorgolewski, Tibor Auer, Vince D Calhoun, Cameron Craddock, Samir Das, Eugene P. Duff, Guillaume Flandin, Satrajit Ghosh, Tristan Glatard, Yaroslav Halchenko, Daniel A. Handwerker, Michael Hanke, David Keator, Xiangrui Li, Zachary Michael, Camille Maumet, B. Nolan Nichols, Thomas E Nichols, Jean-Baptiste Poline, Ariel Rokem, Gunnar Schaefer, Vanessa Sochat, Jessica Turner, Gaël Varoquaux, Russell Poldrack
article
22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2016), Jun 2016, Geneva, Switzerland
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BibTex
titre
NIDM-Results: Standardized reporting of mass univariate neuroimaging results in SPM, FSL and AFNI
auteur
Camille Maumet, B. Nolan Nichols, Guillaume Flandin, Karl Helmer, Tibor Auer, Alexander Bowring, Vanessa Sochat, Samir Das, Tristan Glatard, Richard Reynolds, Robert Cox, Gang Chen, Mark Jenkinson, Matthew A. Webster, Jason Steffener, Krzysztof Gorgolewski, Jessica Turner, Thomas E Nichols, Satrajit Ghosh, Jean-Baptiste Poline, David Keator
article
22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2016), Jun 2016, Geneva, Switzerland
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https://inserm.hal.science/inserm-01570626/file/OHBM2016_Maumet.pdf BibTex
titre
False positives estimation in parametric and non parametric single case Voxel Based Morphometry
auteur
Cristina Scarpazza, Thomas E Nichols, Camille Maumet, Andrea Mechelli, Giuseppe Sartori
article
22nd Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2016), Jun 2016, Geneva, Switzerland
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BibTex

2015

Journal articles

titre
NeuroVault.org: a web-based repository for collecting and sharing unthresholded statistical maps of the human brain
auteur
Krzysztof J. Gorgolewski, Gael Varoquaux, Gabriel Rivera, Yannick Schwarz, Satrajit S. Ghosh, Camille Maumet, Vanessa V. Sochat, Thomas E. Nichols, Russell A. Poldrack, Jean-Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel S. Margulies
article
Frontiers in Neuroinformatics, 2015, 9 (8), ⟨10.3389/fninf.2015.00008⟩
DOI
DOI : 10.3389/fninf.2015.00008
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https://inserm.hal.science/inserm-01134573/file/fninf-09-00008.pdf BibTex
titre
NeuroVault.org: A repository for sharing unthresholded statistical maps, parcellations, and atlases of the human brain
auteur
Krzysztof J. Gorgolewski, Gael Varoquaux, Gabriel Rivera, Yannick Schwartz, Vanessa V. Sochat, Satrajit S. Ghosh, Camille Maumet, Thomas E. Nichols, Jean-Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel S. Margulies, Russell A. Poldrack
article
NeuroImage, 2015, 124 (Pt B), pp.1242-1244. ⟨10.1016/j.neuroimage.2015.04.016⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2015.04.016
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https://inserm.hal.science/inserm-01148969/file/nihms769186.pdf BibTex

Conference papers

titre
Standardizing Metadata in Brain Imaging
auteur
David Keator, Jean-Baptiste Poline, B. Nolan Nichols, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Krzysztof Gorgolewski, Tibor Auer, Cameron Craddock, Gang Chen, Guillaume Flandin, Yaroslav Halchenko, Michael Hanke, Christian Haselgrove, Karl Helmer, Mark Jenkinson, Arno Klein, Linda Lanyon, Daniel Marcus, Daniel Margulies, Frank Michel, Thomas Nichols E., Russell Poldrack, Richard Reynolds, Ziad Saad, Tanya Schmah, Jason Steffener, Jessica Turner, John van Horn, Samir Das, David Kennedy
article
Neuroinformatics 2015, INCF, Aug 2015, Cairns, Australia. ⟨10.3389/conf.fnins.2015.91.00004⟩
DOI
DOI : 10.3389/conf.fnins.2015.91.00004
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BibTex
titre
Brain Imaging Data Structure - a new standard for describing and organizing human neuroimaging data
auteur
Krzysztof Gorgolewski, Jean-Baptiste Poline, David Keator, B. Nolan Nichols, Tibor Auer, R. Cameron Craddock, Guillaume Flandin, Satrajit Ghosh, Vanessa Sochat, Ariel Rokem, Yaroslav Halchenko, Michael Hanke, Christian Haselgrove, Karl Helmer, Camille Maumet, Thomas E. Nichols, Jessica Turner, Samir Das, David Kennedy, Russell Poldrack
article
Neuroinformatics 2015, INCF, Aug 2015, Cairns, Australia. ⟨10.3389/conf.fnins.2015.91.00056⟩
DOI
DOI : 10.3389/conf.fnins.2015.91.00056
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BibTex
titre
Application of the Neuroimaging Data Model to Represent and Exchange Primary and Derived Data
auteur
Nolan B. Nichols, David Keator, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Guillaume Flandin, Thomas E. Nichols, Krzysztof J. Gorgolewski, Y. O. Halchenko, Michael Hanke, Christian Haselgrove, Karl G Helmer, Daniel Marcus, Russell A. Poldrack, Jessica Turner, David N. Kennedy, Jean-Baptiste Poline, K.M. Pohl
article
21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2015), Jun 2015, Honolulu, United States
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https://inserm.hal.science/inserm-01149492/file/2015-OHBM-NIDM-Experiment.pdf BibTex
titre
NeuroVault.org: new features and a proof of concept analysis
auteur
Krzysztof Gorgolewski, Gaël Varoquaux, Gabriel Rivera, Joseph Wexler, Yannick Schwartz, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Thomas E Nichols, Jean Baptiste Poline, Tal Yarkoni, Daniel Margulies, Russell Poldrack
article
21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2015), Jun 2015, Honolulu, United States
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BibTex
titre
Do the units matter? Validity of Intensity Based Meta-Analysis in the presence of unit mismatches
auteur
Camille Maumet, Thomas E. Nichols
article
21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM), Jun 2015, Honolulu, United States
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https://inserm.hal.science/inserm-01149475/file/Maumet-units-OHBM2015.pdf BibTex
titre
Standardized reporting of neuroimaging results with NIDM in SPM, FSL and AFNI
auteur
Camille Maumet, Nolan B. Nichols, Guillaume Flandin, Karl Helmer, Tibor Auer, Richard Reynolds, Ziad Saad, Gang Chen, Mark Jenkinson, Matthew A. Webster, Jason Steffener, Krzysztof J. Gorgolewski, Jessica Turner, Thomas E. Nichols, Satrajit Ghosh, Jean-Baptiste Poline, David Keator
article
21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2015), Jun 2015, Honolulu, United States
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https://inserm.hal.science/inserm-01149484/file/Maumet-NIDMresults-OHBM2015.pdf BibTex
titre
How to make brain imaging research efficient and reproducible: building software and standards
auteur
Jean-Baptiste Poline, Samir Das, David Keator, Krysztof Gorgolewski, Tibor Auer, Gang Chen, Cameron Craddock, Guillaume Flandin, Satrajit Ghosh, Yaroslav Halchenko, Michael Hanke, Christian Haselgrove, Karl Helmer, Mark Jenkinson, Arno Klein, Daniel Marcus, Daniel Margulies, Camille Maumet, Franck Michel, B. Nolan Nichols, Thomas E Nichols, Russell Poldrack, Richard Reynolds, Ziad Saad, Tanya Schmah, Jason Steffener, Jessica Turner, Theo M van Erp, John van Horn, David Kennedy
article
21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2015), Jun 2015, Honolulu, United States
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BibTex
titre
Developing Terminologies for the INCF Neuroimaging Data Model (NIDM)
auteur
Karl Helmer, Jessica Turner, Camille Maumet, Thomas E. Nichols, Nolan B. Nichols, David Keator, Satrajit Ghosh, Tibor Auer, Jean-Baptiste Poline
article
21st Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2015), Jun 2015, Honolulu, United States
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2014

Journal articles

titre
Robust estimation of the cerebral blood flow in arterial spin labelling
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
article
Magnetic Resonance Imaging, 2014, 32 (5), pp.497 - 504. ⟨10.1016/j.mri.2014.01.016⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.mri.2014.01.016
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https://inserm.hal.science/inserm-00942814/file/Maumet_MRI_2014_ASL-M-estimators.pdf BibTex

Conference papers

titre
Extending NI-DM to share the results and provenance of a neuroimaging study: implementation within SPM and FSL.
auteur
Camille Maumet, Guillaume Flandin, B. Nolan Nichols, Jason Steffener, Karl Helmer, Krzysztof Gorgolewski, Tibor Auer, Gully Burns, Fariba Fana, Jessica Turner, Thomas E. Nichols, Satrajit Ghosh, Jean-Baptiste Poline, David Keator
article
7th INCF Congress of Neuroinformatics, Aug 2014, Leiden, Netherlands. ⟨10.3389/conf.fninf.2014.18.00031⟩
DOI
DOI : 10.3389/conf.fninf.2014.18.00031
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BibTex
titre
IBMA: An SPM toolbox for NeuroImaging Image-Based Meta-Analysis
auteur
Camille Maumet, Thomas E. Nichols
article
7th INCF Congress of Neuroinformatics, Aug 2014, Leiden, Netherlands. ⟨10.3389/conf.fninf.2014.18.00025⟩
DOI
DOI : 10.3389/conf.fninf.2014.18.00025
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BibTex
titre
NeuroVault: a web repository for sharing statistical parametric maps
auteur
Krzysztof J. Gorgolewski, Tal Yarkoni, Satrajit Ghosh, Russel A. Poldrack, Jean-Baptiste Poline, Yannick Schwartz, Thomas E. Nichols, Camille Maumet, Daniel S. Margulies
article
20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping, Jun 2014, Hamburg, Germany
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https://inserm.hal.science/inserm-01134575/file/Gorgolewski%20et%20al.%20Poster.pdf BibTex
titre
Is Z enough? Impact of Meta-Analysis using only Z/T images in lieu of estimates and standard errors
auteur
Camille Maumet, Gholamreza Salimi-Khorshidi, Thomas E. Nichols
article
20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2014), Jun 2014, Hamburg, Germany
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BibTex
titre
The Addition of Neuroimaging Acquisition, Processing and Analysis Terms to Neurolex
auteur
Karl Helmer, Satrajit Ghosh, Willy Wong, David Keator, Camille Maumet, B. Nolan Nichols, Nichols E. Thomas, Jean-Baptiste Poline, Jason Steffener, Jessica Turner, Maryann Martone
article
20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2014), Jun 2014, Hamburg, Germany
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BibTex
titre
Extending NI-DM to share the results and provenance of a neuroimaging study: an example with SPM
auteur
Camille Maumet, Thomas E. Nichols, B. Nolan Nichols, Guillaume Flandin, Jessica Turner, Karl Helmer, Jason Steffener, Jean-Baptiste Poline, Satrajit Ghosh, David Keator
article
20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2014), Jun 2014, Hamburg, Germany
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BibTex
titre
Developing and using the Neuroimaging and Data Sharing Data Model: the NIDASH Working Group
auteur
David Keator, Satrajit Ghosh, Camille Maumet, Guillaume Flandin, B. Nolan Nichols, Thomas E. Nichols, Gully Burns, Ruediger Bruehl, Cameron Craddock, Blaise Frederick, Krysztof Gorgolewski, Daniel Marcus, Michael Hanke, Christian Haselgrove, Karl Helmer, Arno Klein, Michael Milham, Russel Poldrack, Franck Michel, Jason Steffener, Yannick Schwartz, Rich Stoner, Jessica Turner, David N. Kennedy, Jean-Baptiste Poline
article
20th Annual Meeting of the Organization for Human Brain Mapping (OHBM 2014), Jun 2014, Hamburg, Germany
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titre
Quantitative Relaxation Templates for the Human Brain at 3T
auteur
Fang Cao, Olivier Commowick, Camille Maumet, Christian Barillot
article
IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, Apr 2014, China. pp.57-60
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https://inserm.hal.science/inserm-00950843/file/paper.pdf BibTex

2013

Journal articles

titre
Corticospinal tract asymmetry and handedness in right- and left-handers by diffusion tensor tractography
auteur
Romuald Seizeur, Elsa Magro, Sylvain Prima, Nicolas Wiest-Daesslé, Camille Maumet, Xavier Morandi
article
Surgical and Radiologic Anatomy, 2013, 36 (2), pp.111-124. ⟨10.1007/s00276-013-1156-7⟩
DOI
DOI : 10.1007/s00276-013-1156-7
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https://inserm.hal.science/inserm-00853861/file/Seizeur_SRA_2013.pdf BibTex
titre
Patient-specific detection of perfusion abnormalities combining within-subject and between-subject variances in Arterial Spin Labeling
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Béatrice Carsin, Christian Barillot
article
NeuroImage, 2013, 81C, pp.121-130. ⟨10.1016/j.neuroimage.2013.04.079⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2013.04.079
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https://inserm.hal.science/inserm-00816852/file/Maumet_NeuroImage_2013.pdf BibTex

Conference papers

titre
Functional Arterial Spin Labeling during a working memory task MRI at 3T. Comparison with BOLD fMRI
auteur
Isabelle Corouge, Elise Bannier, David Travers, Camille Maumet, Jean-Christophe Ferré, Alain Patat, Dominique Drapier, Christian Barillot
article
ESMRMB, Oct 2013, Toulouse, France. pp.242
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titre
Statistical Analysis of White Matter Integrity for the Clinical Study of Specific Language Impairment in Children
auteur
Emmanuel Vallee, Olivier Commowick, Camille Maumet, Aymeric Stamm, Elisabeth Le Rumeur, Catherine Allaire, Jean-Christophe Ferré, Clément de Guibert, Christian Barillot
article
MICCAI 2013 Workshop on Computational Diffusion MRI, Sep 2013, Japan. pp.187-195, ⟨10.1007/978-3-319-02475-2_17⟩
DOI
DOI : 10.1007/978-3-319-02475-2_17
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https://inserm.hal.science/inserm-00849267/file/CDMRI13_Vallee.pdf BibTex
titre
An a contrario approach for the detection of activated brain areas in fMRI
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine 21st Annual Meeting & Exhibition (ISMRM), Apr 2013, Salt Lake City, United States. pp.3260
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https://inserm.hal.science/inserm-00784860/file/Maumet_ISMRM2013_fmri_a_contrario.pdf BibTex
titre
Robust perfusion maps in Arterial Spin Labeling by means of M-estimators
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine 21st Annual Meeting & Exhibition (ISMRM), Apr 2013, Salt Lake City, United States. pp.3037
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https://inserm.hal.science/inserm-00784862/file/Maumet_ISMRM2013_outliers.pdf BibTex

Reports

titre
Patient-Specific Detection of Perfusion Abnormalities Combining Within- and Between-Subject Variances in ASL
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Béatrice Carsin, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
article
[Research Report] RR-8216, INRIA. 2013
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https://inria.hal.science/hal-00781247/file/RR-8216.pdf BibTex

Theses

titre
From group to patient-specific analysis of brain function in arterial spin labelling and BOLD functional MRI
auteur
Camille Maumet
article
Other [cs.OH]. Université de Rennes, 2013. English. ⟨NNT : 2013REN1S042⟩
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https://theses.hal.science/tel-00863908/file/MAUMET_Camille.pdf BibTex

2012

Journal articles

titre
Corticospinal tractography with morphological, functional and diffusion tensor MRI: a comparative study of four deterministic algorithms used in clinical routine.
auteur
Romuald Seizeur, Nicolas Wiest-Daessle, Sylvain Prima, Camille Maumet, Jean-Christophe Ferré, Xavier Morandi
article
Surgical and Radiologic Anatomy, 2012, 34 (8), pp.709-19. ⟨10.1007/s00276-012-0951-x⟩
DOI
DOI : 10.1007/s00276-012-0951-x
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Conference papers

titre
Using negative signal in mono-TI pulsed arterial spin labeling to outline pathological increases in arterial transit times
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Elise Bannier, Christian Barillot
article
ISMRM Scientific Workshop. Perfusion MRI: Standardization, Beyond CBF & Everyday Clinical Applications, Oct 2012, Amsterdam, Netherlands. pp.42
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https://inserm.hal.science/inserm-00767119/file/Maumet_ISMRM_Perfusion2012_Negative_signal.pdf BibTex
titre
Automatic detection of perfusion abnormalities based on an Arterial Spin Labeling template
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
article
ISMRM scientific workshop. Perfusion MRI: Standardization, Beyond CBF & Everyday Clinical Applications, Oct 2012, Netherlands. pp.8
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https://inserm.hal.science/inserm-00767115/file/Maumet_ISMRM_Perfusion2012_Hypo_hyper_perfusions.pdf BibTex
titre
Robust Cerebral Blood Flow Map Estimation in Arterial Spin Labeling
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
article
International Workshop on Multimodal Brain Image Analysis (MBIA), held in conjunction with MICCAI 2012, Oct 2012, Nice, France. pp.215-224
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https://inserm.hal.science/inserm-00724974/file/Maumet_MBIA2012.pdf BibTex
titre
A comprehensive framework for the detection of individual brain perfusion abnormalities using Arterial Spin Labeling
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
article
International Conference on Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention (MICCAI), Oct 2012, Nice, France. pp.542-549
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https://inserm.hal.science/inserm-00720593/file/Maumet_MICCAI2012.pdf BibTex
titre
Voxel Based Analysis of 3D Double Inversion Recovery for the detection of cortical abnormalities in drug resistant epilepsy
auteur
Elise Bannier, Camille Maumet, Anca Pasnicu, Jean-Christophe Ferré, Eduardo Pasqualini, Arnaud Biraben, Jean-Yves Gauvrit, Christian Barillot
article
International Society for Magnetic Resonance in Medicine 20th Annual Meeting & Exhibition (ISMRM), May 2012, Melbourne, Australia. pp.3244
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titre
A contrario detection of focal brain perfusion abnormalities based on an Arterial Spin Labeling template
auteur
Camille Maumet, Pierre Maurel, Elise Bannier, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot
article
9th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI), May 2012, Barcelona, Spain. pp.1176-1179
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https://inserm.hal.science/inserm-00677106/file/Maumet_ISBI2012.pdf BibTex
titre
Analysis of electrodes' placement and deformation in deep brain stimulation from medical images
auteur
Maroua Mehri, Florent Lalys, Camille Maumet, Claire Haegelen, Pierre Jannin
article
SPIE Medical Imaging, Feb 2012, San diego, CA, United States. pp.8316-32, ⟨10.1117/12.912225⟩
DOI
DOI : 10.1117/12.912225
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https://inserm.hal.science/inserm-00669674/file/MarouaMEHRI_MI_2012.pdf BibTex

2011

Journal articles

titre
Abnormal functional lateralization and activity of language brain areas in typical specific language impairment (developmental dysphasia)
auteur
Clément de Guibert, Camille Maumet, Pierre Jannin, Jean-Christophe Ferré, Catherine Tréguier, Christian Barillot, Elisabeth Le Rumeur, Catherine Allaire, Arnaud Biraben
article
Brain - A Journal of Neurology , 2011, 134 (Pt 10), pp.3044-58. ⟨10.1093/brain/awr141⟩
DOI
DOI : 10.1093/brain/awr141
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https://inserm.hal.science/inserm-00607180/file/2011%20Abnormal%20functional%20lateral%20and%20activity%20dysphasia%2C%20Authors%20version.pdf BibTex

Conference papers

titre
Anatomie du tractus cortico-spinal en tractographie : évaluation d'une méthode déterministe
auteur
Romuald Seizeur, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Camille Maumet, Elsa Magro, Jean-Christophe Ferré, Xavier Morandi
article
93ème congrès de l'Association des Morphologistes, Mar 2011, Marne-la-Vallée, France
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titre
Mécanismes physiopathologiques des dysphasies développementales de l'enfant : Apport de l'IRM fonctionnelle à 3 Teslas
auteur
Catherine Allaire, Clément de Guibert, Camille Maumet, Pierre Jannin, Jean-Christophe Ferré, Christian Barillot, Catherine Tréguier, Elisabeth Le Rumeur, Arnaud Biraben
article
Société française de neuropédiatrie, Jan 2011, Lyon, France
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2010

Journal articles

titre
FMRI language mapping in children: a panel of language tasks using visual and auditory stimulation without reading or metalinguistic requirements.
auteur
Clément de Guibert, Camille Maumet, Jean-Christophe Ferré, Pierre Jannin, Arnaud Biraben, Catherine Allaire, Christian Barillot, Elisabeth Le Rumeur
article
NeuroImage, 2010, 51 (2), pp.897-909. ⟨10.1016/j.neuroimage.2010.02.054⟩
DOI
DOI : 10.1016/j.neuroimage.2010.02.054
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https://inserm.hal.science/inserm-00461666/file/2010_de_Guibert_fMRI_language_mapping_children.pdf BibTex

Conference papers

titre
Étude du tractus cortico-spinal en tractographie : analyse comparative de 4 algorithmes
auteur
Romuald Seizeur, Nicolas Wiest-Daesslé, Sylvain Prima, Camille Maumet, Elsa Magro, Jean-Christophe Ferré, Xavier Morandi
article
Réunion Annuelle de Paris (RAP) de la Société de NeuroChirurgie de Langue Française (SNCLF), Dec 2010, Marne-la-Vallée, France
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https://inserm.hal.science/inserm-00601401/file/SNLF2010.pdf BibTex